El 29 de julio de 1966, las universidades nacionales fueron intervenidas y ocupadas militarmente en el episodio que se conoce como la “noche de los bastones largos”. Cientos de profesores, alumnos y no docentes que ocupaban varios de los edificios de las facultades de Buenos Aires en defensa de la autonomía universitaria y la libertad de cátedra fueron salvajemente golpeados por miembros de la Guardia de Infantería de la Policía Federal, enviados por Onganía, quien decretó la intervención a las universidades nacionales y la “depuración” académica, es decir, la expulsión de las casas de altos estudios a los profesores opositores, sin importar su nivel académico. 

En los meses siguientes cientos de profesores fueron despedidos, renunciaron a sus cátedras o abandonaron el país. Unos 70.000 estudiantes no corrieron con la misma suerte. La mayoría vio frustradas la promesa de rápido ascenso social y sus ambiciones reformistas. Algunos se convencieron de que sólo una acción igualmente violenta, de signo inverso, modificaría la situación. La radicalización de estos jóvenes y viraje cada vez más notorio a la izquierda se reflejaría luego en el Cordobazo.

En total emigraron 301 profesores universitarios; de ellos 215 eran científicos; 166 se insertaron en universidades latinoamericanas, básicamente en Chile y Venezuela; otros 94 se fueron a universidades de Estados Unidos, Canadá y Puerto Rico; los 41 restantes se instalaron en Europa. La Fundación Ford organizó un operativo de rescate para reubicar a los profesores opositores al nuevo contexto universitario en universidades norteamericanas y sudamericanas vinculadas económicamente a la Fundación, como era el caso de la Universidad de Chile.

La noche del 29 de junio fue el inicio de una serie de persecuciones y purgas que se prolongará por más de 15 años. Fue el fin de Eudeba. Como consecuencia, Boris Spivacow fundó en el mismo año el Centro Editor de América Latina, que sirvió para la difusión cultural y científica. De hecho, esta represión en los ámbitos públicos contrastó con la explosión de la actividad editorial privada.

Reconocimiento y Memoria

En julio de 2005 la Federación Universitaria Argentina entregó diplomas de reconocimiento a los 70 profesores universitarios que renunciaron en 1966 a sus cátedras en la Facultad de Agronomía de la UBA.

En 2004 el director de cine Tristán Bauer estrenó una película con el título «La noche de los bastones largos: el futuro intervenido».

El 8 de septiembre de 2010, el unitario televisivo «Lo que el tiempo nos dejó» presentó un capítulo referido a «La noche de los bastones largos».